Su funcionamiento es a través de los buscadores, como Google o Yahoo. Los usuarios, al utilizar algunos de los motores de búsqueda habituales, eligen una palabra, que está encadenada a un banner de un determinado negocio. El anunciante paga una cantidad prefijada por cada click que los clientes hacen sobre su banner, lo que en una situación normal, no supone un gasto, sino todo lo contrario. El click fraudulento hace que los internautas pulsen repetidas veces con su ratón sobre un banner sin efectuar compra alguna, lo que reporta al anunciante unos gastos con los que no contaba.

Tammy Harrison utilizaba un buscador para poner su anuncio, y pagaba 20 dólares por cada click. La mujer, que terminó perdiendo mucho dinero víctima del click fraudulento afirmaba que "el click-fraud está fuera de control". Esta actividad favoreció a los propios buscadores, que se enriquecieron en un primer momento. Sin embargo, en la actualidad, tanto Google como Yahoo apuestan por un mayor control y vigilancia para evitar que esto se convierta en una epidemia. Eric Schmidt, jefe ejecutivo de Google, dijo: "Siempre nos preocupa el tema, pero todavía no es algo que se pueda medir en forma concreta"

Por su parte, el buscador Google ya ha ganado su primer juicio a causa del click fraudulento contra Auction Experts International, aunque el abogado de la compañía aseguraba que este no será el único juicio que la empresa tendrá que hacer frente por este tema.